Informática

Supercomputador mais rápido do mundo entra na batalha contra o COVID-19

O COVID-19 tem um novo inimigo temível: o supercomputador mais rápido do mundo.

Os biofísicos da Universidade do Tennessee usaram o supercomputador SUMMIT, construído pela IBM, para filtrar milhares de moléculas e encontrar possíveis compostos que poderiam ser usados ​​como uma nova droga contra o SARS-CoV-2, o coronavírus responsável pela  atual pandemia de COVID-19. 

Após alguns dias de cálculos, o supercomputador conseguiu encontrar pelo menos 77 compostos que indicam que eles poderiam ajudar a impedir que o  SARS-CoV-2  invadisse as células humanas. 

As descobertas foram publicadas recentemente em um artigo disponível no servidor de pré-impressão  ChemRxiv. Significa que o trabalho está aguardando a revisão por pares, portanto a pesquisa deve ser considerada um “trabalho em andamento”.  

As superfícies dos coronavírus são cobertas por proteínas parecidas com coroas (daí o nome) que permitem que os vírus se liguem e infectem células humanas, um pouco como uma chave e fechadura. Ao entender as proteínas dos vírus e os receptores das células humanas, bem como a maneira como outros compostos químicos interagem com eles, é possível descobrir como as drogas podem ser eficazes contra o patógeno. 

O SUMMIT foi usado para analisar profundamente um banco de dados de mais de 8.000 compostos conhecidos de medicamentos, produtos químicos, fitoterápicos e produtos naturais existentes. Seu trabalho era farejar compostos que parecem ser capazes de se ligar aos picos de proteína SARS-CoV-2, bloqueando a chave do vírus e teoricamente impedindo-o de invadir as células do corpo.

“Levamos um dia ou dois, enquanto levaria meses em um computador normal”, disse o autor do estudo Jeremy Smith, diretor do Centro de Biofísica Molecular da Universidade do Tennessee, em comunicado.

O composto, mostrado em cinza, foi calculado para se ligar à proteína spike SARS-CoV-2, mostrada em ciano, para impedir que ela se encaixe no receptor de células humanas, mostrado em roxo. Micholas Smith / Laboratório Nacional Oak Ridge, Departamento de Energia dos EUA

Obviamente, não há garantia de que nenhum dos compostos encontrados pelo supercomputador seja eficaz na prática. Além disso, assim como qualquer medicamento, será necessário extensos testes e ensaios clínicos antes de ser considerado um tratamento viável. No entanto, o trabalho do supercomputador ajudou a identificar alguns candidatos promissores para os pesquisadores acompanharem.

“Nossos resultados não significam que encontramos uma cura ou tratamento para o COVID-19”, disse Smith. “Estamos muito esperançosos, no entanto, de que nossas descobertas computacionais informem estudos futuros e forneçam uma estrutura que os experimentalistas usarão para investigar melhor esses compostos. Só então saberemos se algum deles apresenta as características necessárias para mitigar esse vírus. ” 

SUMMIT é descrito como a “Fórmula 1 dos supercomputadores”. Encontrado no Laboratório Nacional de Oak Ridge, no Tennessee, o supercomputador é do tamanho de duas quadras de tênis e é capaz de processar mais de 200 quatrilhões de cálculos por segundo. É usado por uma variedade de pesquisadores, desde modelagem de supernovas e meio ambiente até dados detalhados sobre câncer e genética.

Esta pesquisa não é a primeira a usar computadores para encontrar novos medicamentos. No mês passado, os pesquisadores usaram um novo algoritmo de computador para vasculhar um vasto arquivo digital de mais de 100 milhões de compostos químicos e descobriram uma molécula que parecia possuir propriedades antibióticas verdadeiramente notáveis.

Fonte: Iflscience

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